感知與溝通

小鼠主要透過發出聲音及散發氣味(費洛蒙)進行溝通。費洛蒙由包皮腺製造與排出，但也存在於淚液及尿液中。在所有感官之中，嗅覺是最發達的，費洛蒙有助於溝通，可作為掠食者出現的警戒訊號，並在性成熟方面發揮作用。在小鼠，費洛蒙主要被位於鼻腔底部，稱為犁鼻器之嗅覺器官感知。

超音波溝通

小鼠能夠聽見人類可聽到的頻率範圍以外的聲音(超音波)。在溝通上，小鼠會產生類可聽見之聲音及聽不見的超音波 (請參見影片)。

小鼠用牠們的鬍鬚來感知物體和空氣的移動。鬍鬚的彎曲導致附著在毛囊上的神經受到刺激，而這些神經脈衝訊號被傳遞到大腦皮層。

小鼠為夜行性動物，牠們幾乎無法感知色彩，對於高強度光線敏感，尤其是白化動物。若暴露於強度超過60 lux 的光線中，會使視網膜降解。